毕业5年了，档案一直没有管，现在人事部门说档案没在他们那里，我当时拿着报到证去人事局报到了

人事局早就不存在了，人事局与劳动局早就合并为人力资源与社会保障局了。

你当时到那里报到应该马上办理人事档案代理事宜，由于人事局不是管理你的档案的法定机构，所以他们只能暂存你的档案，一般暂存的有效期为2年，这期间你应该赶紧找到工作，然后将档案转到有认识管理权的单位（如国企、行政事业单位等），如果你没能签约这类单位，而是签约了私企，那么你就该在2年之内将你的档案转到企业所在地的人才交流服务中心，并马上办理人事档案代理。这样才能是你的学校的学籍档案转为国家干部的人事档案。国家给予你的国家干部身份就是这样办理才能真正实现你成为国家干部人事档案管理的的渠道，且这个渠道的有效期只有2年，过期作废。超过这个期限的档案自动转为社会人员档案。不过不管怎样，你的学籍档案应该不会丢失。你当时报到后有没有给你凭证？有凭证应该可以找他们索要你的学籍档案。但是要想恢复成人事档案管理，估计非常难。这也是好多学生毕业后对自己的档案弃置不管的后果。